V roce 1986 byla založena brněnská pobočka tehdejšího Výzkumného ústavu pro zúrodnění zemědělských půd Praha. Pro tuto pobočku byla postavena nová budova na Lidické ulici 25/27 v Brně, do níž se nastěhovali pracovníci dosavadní půdní služby VÚZZP v Rosicích a pracovníci židlochovické stanice, kde sídlilo oddělení meliorací. Byli přijati noví pracovníci, takže pobočka v roce 1987 čítala 100 zaměstnanců v odděleních:
Vedoucí pobočky v letech 1986-1989: RSDr. Stanislav Kamenický
Po roce 1990 došlo k delimitaci většiny pracovníků pobočky do nově zřizované Agentury ochrany a přírody (tehdy ČÚOP - Český ústav ochrany přírody) pod MŽP. Celá budova byla rovněž předána do majetku MŽP. Pobočka po delimitaci měla 30 zaměstnanců. VÚZZP byl přejmenován na Výzkumný ústav meliorací a ochrany půdy Praha.
Vedoucí pobočky v letech 1990 - 1991: Ing. František Toman,CSc.
V roce 1992 pobočka získala statut samostatného oddělení Pozemkových úprav Brno. Jejími pracovníky byli a jsou techničtí a výzkumní pracovníci v oboru pozemkových úprav, ochrany a tvorby krajiny a meliorací a pracovníci bonitace zemědělských půd.
Vedoucí v letech 1992 - 2001: Ing. Miroslav Dumbrovský, CSc.
Vedoucí v letech 2002-2003: Ing. Pavel Spitz, CSc.
Vedoucí v letech 2004-2005: Ing. Radim Czelis
V roce 2005 bylo brněnské pracoviště rozděleno na oddělení pozemkových úprav a oddělení půdní služby - pracovní tým půdního mapování a bonitace Brno.
V roce 2007 byl na brněnské pracoviště přesunut další tým oddělení půdní služby - pracovní tým GIS Brno.
Vedoucí odd. pozemkových úprav: Ing. Jana Podhrázská, Ph.D.
Vedoucí pracovního týmu půdního mapování a bonitace Brno: Ing. Radim Czelis
Vedoucí pracovního týmu GIS Brno: Aleš Sekanina